Ingénieur d'Études - Métagénomique Clinique H/F - 31

Mission 1 : virologie clinique (diagnostic et recherche) : biologie moléculaire
· Réceptionner, enregistrer et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, Tenir un cahier d'expériences, rassembler les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.
· Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d'analyse utilisant un ensemble de techniques, notamment en biologie moléculaire (PCR conventionnelle, PCR temps réel, PCR digitale).
· Actualiser le dossier de protocoles techniques.

Missions 2 : métagénomique clinique
· Participer à la mise au point et mettre en oeuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléiques en vue du séquençage NGS (technologie Oxford Nanopore notamment)
· Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage.
· Prise en charge des données de séquençage NGS : sauvegarde, contrôle qualité.

Mission 3 : missions transversales d'appui à l'activité du laboratoire de virologie clinique
· Contribuer à la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l'entretiendu laboratoire
· Se former à la mise en oeuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner lesutilisateurs
· Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d'hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits
· Participer à la gestion des stocks et des commandes