Ingénieur d'Études Biologiste en Traitement de Données H/F - Service Public

Au coeur de l'Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs...), stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer.
Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche, les soins et l'enseignement, dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein d'un centre technologique.Dans un cadre de recherche clinique sur la résistance aux thérapies, nous recherchons un(e) bioinformaticien(ne) pour assurer le traitement et l'analyse des données de séquençage ADN circulant et ARN.MISSIONS PRINCIPALES :Traitement des données (Pipeline) : Mise en oeuvre et optimisation de pipelines de traitement (QC, alignement, quantification), appel de variantsAnalyse de l'expression différentielle : Identification des gènes différentiellement exprimésIdentification de signatures moléculaires de l'adaptation ou la résistance tumoraleAnalyse fonctionnelle : Interprétation des signatures (Gene Ontology, GSEA, Pathways, etc.)Visualisation : Création de figures pour publication (Heatmaps, Volcano plots, PCA, etc.)Gestion de données : Organisation des fichiers et archivage des résultatsCDD de 9 mois, non renouvelable - temps plein - 38h30REMUNERATION : À partir de 2421,65€ brut mensuel en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent.Emploi-TypeA2A41 - Ingénieur-e biologiste en traitement de donnéesPour en savoir +· Sur l'Inserm: ; site RH: · Sur la politique handicap de l'Inserm et sur la mise en place d'aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap:

APTITUDES :Rigueur méthodologiqueEsprit de synthèseCapacité à travailler en autonomieEXPERIENCES SOUHAITEES :Une expérience en analyse RNAseq sera appréciéeUne expérience sur environnement Linux/Unix (ligne de commande) sera appréciéeUne expérience avec un ordonnanceur (Slurm) sera appréciée

• Gestion des données
• Autonomie
• UNIX
• Analyse de données
• HP Quality Center
• Linux
• Analyse fonctionnelle