Thèse l'Influence de l'Empreinte Natale sur la Dispersion Émancipation Transience et Succès d'Installation - Vers une Connectivité Individu-Centrée H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse École doctorale : SEVAB - Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingenieries Laboratoire de recherche : CEFS - Laboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage Direction de la thèse : Mark HEWISON ORCID 0000000222764154 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-01T23:59:59 L'environnement dans lequel un individu vie pendant la phase précoce a des effets notables sur son développement physique et comportemental. En particulier, l'empreinte de son environnement maternel pendant l'ontogénèse peut canaliser des préférences comportementales qui persisteront pour toute sa vie. Ce projet de thèse évaluera l'impact des conditions environnementales en termes de type et de qualité de l'habitat rencontré pendant la phase post-natale sur les décisions comportementales prises lors de la dispersion, y compris l'émancipation, la transience et l'installation. En effet, la dispersion natale est un processus fondamental qui détermine le flux de gènes et la dynamique des populations spatialement structurées, mais nous avons peu d'information sur comment l'ontogénèse détermine la prise de décisions de quand, où et comment disperser. Pour répondre à cette question, ce projet de thèse analysera un jeu de données exceptionnelles sur plus que 300 juvéniles de chevreuils pour lesquels il y a des informations détaillées sur leurs habitats, leurs mouvements, leur croissance et physiologie etc. pour évaluer l'influence des conditions vécues pendant la phase précoce sur le processus de la dispersion natale dans un paysage agricole fragmenté. En particulier, le projet évaluera comment l'empreinte natale influe sur i/ le processus d'émancipation lors de la rupture du lien mère-jeune, ii/ la vitesse de déplacement, la direction de la trajectoire et l'utilisation de l'habitat (par ex. en fonction des infrastructures humaines) pendant la transience de la dispersion natale, lorsque l'animal se déplace à travers un paysage inconnu, et iii/ l'avenir des disperseurs en termes de réussite de l'installation (vs avortée), de composition du domaine vital post-dispersion, et de mortalité juvénile chez le chevreuil. Par la suite, nous évaluerons la variation interindividuelle de la perception de la connectivité du paysage pendant la transience et de la qualité de l'habitat à l'installation en fonction de l'empreinte natale (par ex. sélection pour un habitat particulier le long de la trajectoire de dispersion ou au niveau du domaine vital post-dispersion), ce qui conduirait vers une dispersion phénotype-dépendante (direction, distance, tortuosité). La dispersion natale est un processus biologique fondamental affectant la valeur adaptive des individus (Clobert 2001), les flux de gènes (Ronce 2007) et la dynamique spatiale des populations (Bowler & Benton 2005). Elle englobe l'ensemble des déplacements entre le site de naissance et le premier site de reproduction, et se compose en trois phases, l'émigration, la transience et l'installation (Clobert 2001). En termes proximaux, ce processus est gouverné par des décisions comportementales à chacune de ces phases, notamment en termes de relations sociales et de sélection de l'habitat, qui auraient pour partie leur origine dans l'ontogenèse du comportement pendant la phase précoce.
Les conditions qu'un individu rencontre pendant son développement, et en particulier l'environnement maternel pendant la phase précoce, devraient laisser une empreinte écologique (Immelmann 1975). Par exemple, la sélection de l'habitat pour un stimulus qui a été rencontré dans l'environnement natal pourrait être innée à travers une prédisposition génétique pour des environnements qui augmenteraient leur valeur adaptative, ou sous l'influence ontogénétique de l'expérience acquise pendant la phase de dépendance avec la mère. Cependant, il semblerait que l'influence de l'expérience précoce soit prépondérante pour canaliser les préférences individuelles en termes d'habitat (Immelmann 1975), ainsi l'empreinte pour des conditions expérimentées dans l'environnement maternel pourrait être déterminante pour expliquer les variations entre individus dans la sélection de l'habitat (Larue et al. 2018).
Ce mécanisme ontogénétique du comportement de sélection de l'habitat est particulièrement attendu pendant la phase de dispersion natale. En effet, à ce moment critique de l'histoire de vie, l'individu doit subir la rupture de la relation mère-jeune pendant son émancipation, puis se déplacer à travers un paysage étranger totalement inconnu. Bien qu'il y ait quelques études qui suggèrent que des préférences développées pendant la phase précoce jouent un rôle dans les décisions comportementales des disperseurs chez les mammifères (Merrick & Koprowski 2016), à ce jour il n'existe aucune évaluation de l'influence des conditions précoces post-natales et de l'ontogenèse comportementale sur les choix effectués par les animaux le long de la trajectoire de dispersion lors de la phase de transience.
La compréhension des mécanismes qui déterminent les caractéristiques de dispersion (timing, direction, distance, tortuosité, habitats) devient crucial pour mesurer l'impact de la modification de l'usage du sol par les activités humaines sur la faune sauvage. En effet, la fragmentation des paysages due à la perte d'habitats et aux infrastructures augmente le coût de la dispersion et rend les populations sauvages plus vulnérables. Cette thèse contribuera ainsi à identifier comment des modifications de la structure du paysage peuvent agir comme filtre, en affectant des individus de manière variable en fonction de leur expérience précoce et de leur phénotype, ainsi générant une connectivité individu centrée.
En s'appuyant sur le suivi à long terme d'une population de chevreuils (Capreolus capreolus) dans les Vallons et Coteaux de Gascogne, au sein de la Zone Atelier Pygar, cette thèse s'intéressera aux questions suivantes :
- comment lexpérience précoce en termes d'environnement et des relations mère-jeune influencent le processus d'émancipation qui précède la dispersion natale ?
- comment les conditions environnementales expérimentées par un individu pendant son développement précoce influencent la direction, la distance et la trajectoire de son déplacement pendant la phase de transience de dispersion ?
- quel est le rôle de l'empreinte natale sur le succès de la dispersion et le choix du domaine vital post-dispersion ?
La personne aura accès à une base de données sans équivalent au niveau international, composée de plus de 300 chevreuils juvéniles suivis pendant la phase de dispersion à environ un an d'âge. La base sera augmentée d'environs 20 individus de plus par an pendant les 2 premières années de la thèse dans le cadre du suivi à long-terme sur le site VCG (ZA Pygar). Nous avons des données pour un nombre important de caractéristiques phénotypiques pour chaque individu (sexe, masse, comportement, mouvements, charge parasitaire, marqueurs physiologique etc), ainsi que pour les conditions environnementales et sociales qu'il a expérimenté pendant la première année de vie (habitat, météo, densité, présence de sibling, relations mère-jeune, etc.).
L'analyse sera basée sur des métriques de mouvement (e.g. vitesse, tortuosité etc.) et de sélection de l'habitat avec des approches de type Resource Selection Functions et Step Selection Functions. On évaluera la répétabilité individuelle des caractéristiques de mouvement et de préférences pour les habitas entre les différentes phases de vie, de la naissance jusqu'à l'installation dans le domaine vital post-dispersion, avec des modèles mixtes en prenant en compte le résultat final de la dispersion (succès, avortée, mort).

Nous recherchons un/e étudiant/e motivé/e par la recherche fondamentale, ayant un fort intérêt pour l'écologie comportementale, l'analyse de données, et le travail de terrain. Une bonne connaissance de R et un intérêt pour la modélisation statistique, et potentiellement des notions sur ArcGIS ou QGIS seront des atouts. Un bon niveau en anglais est important.