Thèse Etude des Mécanismes Moléculaires et Épigénétiques de la Régulation Génique au Cours de l'Hypertrophie et l'Insuffisance Cardiaque H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse
École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies
Laboratoire de recherche : I2MC - Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires
Direction de la thèse : Caroline CONTE ORCID 0000000169820478
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-06-30T23:59:59Au laboratoire, nous essayons de comprendre les mécanismes impliqués dans le développement des pathologies cardiaques en étroite collaboration avec les cliniciens de l'hôpital de Rangueil. Chez les patients, l'hypertrophie cardiaque pathologique est une étape transitoire de réponse au stress observée au cours du développement de nombreuses maladies cardiaques, notamment l'ischémie, l'hypertension, la sténose aortique ou les formes génétiques de cardiomyopathie. Elle est associée à une reprogrammation de l'expression des gènes, en particulier on observe une ré-expression des gènes foetaux. Les facteurs de transcription impliqués dans cette reprogrammation des gènes ont été largement étudiés. Cependant, nous savons maintenant que leur action dépend du remodelage de la chromatine. Certaines des marques épigénétiques impliquées dans le remodelage de la chromatine induite par le stress ont été identifiées mais seul un petit nombre de facteurs de remodelage de la chromatine a été identifié. De plus, les mécanismes de régulation de leur activité et/ou de leur recrutement sur leurs gènes cibles en réponse au stress cardiaque sont encore très mal connus.
De façon intéressante, nous avons récemment identifié plusieurs facteurs de remodelage de la chromatine qui interagissent avec des acteurs clés des voies de signalisation induites par le stress cardiaque.
L'objectif de la thèse sera : (1) de mieux caractériser le rôle de ces facteurs de remodelage de la chromatine au niveau cellulaire et dans des modèles murins ; (2) d'identifier leurs partenaires moléculaires et leurs gènes cibles ; (3) d'étudier l'impact des voies de signalisation sur leurs activités enzymatiques et leur recrutement afin de comprendre les mécanismes moléculaires de régulation de leurs gènes cibles en réponse au stress cardiaque.
Ce projet de recherche permettra d'identifier de nouveaux acteurs moléculaires impliqués dans la mise en place de l'épigénome des cardiomyocytes ainsi que les mécanismes de régulation de ces acteurs. Ces connaissances pourront avoir plusieurs
retombées: l'identification de gènes et/ou réseaux géniques dont les
produits pourraient s'avérer être de bons marqueurs précoces de pathologies cardiaques et la preuve de concept que les enzymes épigénétiques pourraient être des cibles thérapeutiques prometteuses.

Les maladies cardiovasculaires constituent l'une des principales causes de morbidité et de mortalité dans le monde. L'équipe cherche à comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans l'insuffisance cardiaque (IC). L'objectif final est d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques pour prévenir ou freiner la progression de l'IC.

Isolement et culture de cardiomyocytes de rat et de souris
Transfection de siARN et de plasmides
Construction de plasmides et de vecteurs viraux
Transduction par AAV in vitro (cellules) et in vivo (modèles murins)
Western blot, immunoprécipitation
RT-qPCR, ChIP, ChIP-seq

Le/la candidat(e) devra posséder de solides connaissances en biologie moléculaire et manifester un intérêt pour la physiologie et la signalisation cellulaire.
Une bonne maîtrise de l'anglais, à l'oral comme à l'écrit, ainsi que des outils informatiques de base (bases de données NCBI, suite bureautique) est requise.
Des compétences en bioinformatique seraient appréciées.